上海大學(xué)量子與分子結(jié)構(gòu)國(guó)際中心主辦“2016年蛋白質(zhì)晶體結(jié)構(gòu)精修軟件PHENIX應(yīng)用國(guó)際研討會(huì)”(International Workshop on Applications of Protein Structure Refinement Program PHENIX)。由上海大學(xué)理學(xué)院Jeffrey Reimers院士和任偉教授擔(dān)任會(huì)議主席,美國(guó)勞倫斯伯克利國(guó)家實(shí)驗(yàn)室的Pavel Afonine博士、Paul Adams博士、美國(guó)洛斯阿拉莫斯國(guó)家實(shí)驗(yàn)室的Tom Terwilliger博士及英國(guó)劍橋大學(xué)的Randy Read 教授應(yīng)邀做了主題報(bào)告。
上海大學(xué)有數(shù)學(xué) 、物理學(xué)、化學(xué)、系統(tǒng)科學(xué)、統(tǒng)計(jì)學(xué) 、中國(guó)語(yǔ)言文學(xué)、中國(guó)史 、世界史外國(guó)語(yǔ)言文學(xué)、管理科學(xué)與工程、工商管理 、法學(xué)、信息與通信工程、生物醫(yī)學(xué)工程計(jì)算機(jī)科學(xué)與技術(shù)、機(jī)械工程、儀器科學(xué)與技術(shù)、電氣工程 、控制科學(xué)與工程、材料科學(xué)與工程、冶金工程、化學(xué)工程與技術(shù)、環(huán)境科學(xué)與工程、生物學(xué)生態(tài)學(xué)、藝術(shù)學(xué)理論美術(shù)學(xué)、設(shè)計(jì)學(xué)、新聞傳播學(xué)、藝術(shù)學(xué)理論、戲劇與影視學(xué)、管理科學(xué)與工程、哲學(xué)、馬克思主義理論、土木工程、設(shè)計(jì)學(xué)、社會(huì)學(xué)、力學(xué)、音樂(lè)與舞蹈學(xué)、理論經(jīng)濟(jì)學(xué)、應(yīng)用經(jīng)濟(jì)學(xué)、統(tǒng)計(jì)學(xué)圖書(shū)館、情報(bào)與檔案管理一級(jí)學(xué)科在職碩士點(diǎn)。
上海大學(xué)量子與分子結(jié)構(gòu)國(guó)際中心執(zhí)行主任任偉教授主持開(kāi)幕式,主任Jeffrey Reimers院士致歡迎辭。 Paul Adams博士具體闡述了PHENIX軟件的設(shè)計(jì)思想和主要特色,并對(duì)目前分子結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)庫(kù)中存在大量結(jié)構(gòu)解析并不理想的現(xiàn)狀進(jìn)行了描述。Tom Terwilliger博士深入講解了如何設(shè)計(jì)SAD(single wavelength anomalous diffraction)以及如何進(jìn)行結(jié)果分析,有助于理解不同反射次數(shù)以及設(shè)置點(diǎn)數(shù)等對(duì)獲得更為準(zhǔn)確的亞結(jié)構(gòu)的影響。Tom Terwilliger博士還分享了如何建立模型,甚至是使用低分辨率的數(shù)據(jù)建立模型以及密度修正來(lái)獲得更為精確的結(jié)果的具體過(guò)程和相關(guān)經(jīng)驗(yàn)。Randy教授講授了一種巧妙地建立模型的思路——分子替換法,此方法可以有效的對(duì)未知結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)進(jìn)行解析。Pavel博士則重點(diǎn)介紹了生物大分子的單晶結(jié)構(gòu)解析現(xiàn)狀和低溫冷凍電鏡蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)的解析與精修。參會(huì)老師同學(xué)積極交流,討論充分收益匪淺。會(huì)議于15日下午5點(diǎn)圓滿落幕。
本次研討會(huì)基于PHENIX軟件,結(jié)合實(shí)際體系中的應(yīng)用,對(duì)蛋白質(zhì)晶體結(jié)構(gòu)精修的方法學(xué)展開(kāi)了深入的討論,論述了與蛋白質(zhì)晶體結(jié)構(gòu)精修有關(guān)的重要實(shí)驗(yàn)結(jié)果、建模、實(shí)驗(yàn)工具和理論工具。本次研討會(huì)對(duì)所有與會(huì)者及廣大從事蛋白質(zhì)晶體結(jié)構(gòu)研究的科研工作者提升自身業(yè)務(wù)水平,以及互相之間展開(kāi)全方位的有效合作研究起到了積極的推動(dòng)作用。