近日,湖北大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院、省部共建生物催化與酶工程國家重點實驗室吳姍教授團(tuán)隊與浙江大學(xué)醫(yī)學(xué)院郭江濤教授團(tuán)隊、楊帆教授團(tuán)隊合作,在國際重要學(xué)術(shù)期刊Nature在線發(fā)表題為“Structures and mechanisms of the Arabidopsis auxin transporter PIN3”(擬南芥生長素轉(zhuǎn)運蛋白PIN3的結(jié)構(gòu)和機(jī)制)的研究論文。該研究報道了擬南芥PIN3(AtPIN3)在apo狀態(tài)、生長素吲哚乙酸IAA結(jié)合狀態(tài)和NPA結(jié)合狀態(tài)下的3個高分辨率冷凍電鏡結(jié)構(gòu),為理解PIN介導(dǎo)生長素轉(zhuǎn)運和NPA抑制生長素極性運輸?shù)姆肿訖C(jī)制提供了結(jié)構(gòu)基礎(chǔ),進(jìn)而為靶向該轉(zhuǎn)運體的創(chuàng)新農(nóng)藥研發(fā)打下基礎(chǔ)。這是湖北大學(xué)首次以通訊單位在Nature發(fā)表研究論文。
生長素是最重要的一類植物激素,對植物生長發(fā)育起核心調(diào)控作用。在種子植物中,生長素主要通過極性運輸或者維管系統(tǒng)進(jìn)行運輸。PIN家族蛋白介導(dǎo)生長素外排,是承擔(dān)植物體生長素極性運輸?shù)淖钪匾霓D(zhuǎn)運蛋白。PIN突變體會影響PIN極性定位和活性,從而導(dǎo)致生長素分布失衡。NPA(N-1-naphthylphthalamic acid)是一種除草劑,也是生長素極性運輸?shù)囊种苿。長期以來,人們對PIN如何介導(dǎo)生長素的外排,以及NPA如何抑制生長素的極性運輸?shù)姆肿訖C(jī)制尚不清楚。研究人員通過單顆粒冷凍電鏡技術(shù),解析了AtPIN3在apo狀態(tài)、NPA結(jié)合狀態(tài)以及IAA結(jié)合狀態(tài)下的高分辨率結(jié)構(gòu)。三個結(jié)構(gòu)類似,且均為向內(nèi)開放狀態(tài)。AtPIN3NPA和AtPIN3IAA復(fù)合物結(jié)構(gòu)清楚地揭示了NPA、IAA與AtPIN3的結(jié)合模式。NPA與IAA的結(jié)合模式類似,抑制劑NPA和底物IAA的結(jié)合位點重疊,揭示了NPA抑制生長素極性運輸?shù)姆肿訖C(jī)制:NPA作為競爭性抑制劑,直接占據(jù)生長素在PIN上的結(jié)合位點,并抑制了轉(zhuǎn)運過程中PIN的潛在構(gòu)象變化。
隨后,為了進(jìn)一步驗證IAA和NPA在AtPIN3中的結(jié)合模式,研究人員對AtPIN3上與IAA和NPA有相互作用的殘基進(jìn)行了點突變,并在體外放射性3H-IAA轉(zhuǎn)運實驗體系中檢驗其功能。此外,研究人員將野生型AtPIN3和突變體進(jìn)行表達(dá)純化,通過表面等離子體共振技術(shù)(SPR),測定了AtPIN3分別與IAA和NPA的解離常數(shù)(KD)。兩者實驗結(jié)果進(jìn)一步驗證了冷凍電鏡結(jié)構(gòu)中觀察到的IAA和NPA與AtPIN3的結(jié)合模式。本文系統(tǒng)性地解析了AtPIN3在apo狀態(tài)、底物(IAA)結(jié)合狀態(tài)以及抑制劑(NPA)結(jié)合狀態(tài)下的高分率結(jié)構(gòu),揭示了AtPIN3的結(jié)構(gòu)、IAA識別機(jī)制及NPA抑制的分子機(jī)制,將有力促進(jìn)對PIN介導(dǎo)的生長素運輸分子機(jī)制的理解(圖2)。
據(jù)悉,湖北大學(xué)與浙江大學(xué)為本文共同通訊單位,郭江濤教授、吳姍教授和楊帆教授為共同通訊作者,浙江大學(xué)醫(yī)學(xué)院博士后蘇楠楠、博士生竺愛琴和湖北大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院博士生陶鑫為共同第一作者,參與這項工作的還有湖北大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院馬立新教授等。
吳姍教授2019年初加入湖北大學(xué),負(fù)責(zé)搭建湖北大學(xué)冷凍電鏡平臺。本文為湖北大學(xué)冷凍電鏡平臺2021年7月正式運行以來第一篇在線發(fā)表的高水平文章。吳姍教授團(tuán)隊長期從事生物大分子的精細(xì)結(jié)構(gòu)解析與相關(guān)分子機(jī)制研究,在Nature、Science、Nature Structural&Molecular Biology、Nature Communications等國際知名期刊上發(fā)表多篇高水平文章。本研究工作受國家自然科學(xué)基金委、國家重點研發(fā)計劃等資助。