內(nèi)蒙古醫(yī)科大學設有金山校區(qū)（主校區(qū)）、新華校區(qū)、錫林校區(qū)及紅山口教學基地。獲得同等學力人員申請碩士學位的授權(quán)資格，現(xiàn)有1個博士學位授權(quán)一級學科，有中醫(yī)學（蒙醫(yī)）1個博士一級學科；基礎醫(yī)學、臨床醫(yī)學、中醫(yī)學、藥學、中藥學、護理學、生物學、口腔醫(yī)學、公共衛(wèi)生與預防醫(yī)學9個碩士一級學科；臨床醫(yī)學、口腔醫(yī)學、公共衛(wèi)生、護理、藥學、中醫(yī)、公共管理7個碩士專業(yè)學位類別。專業(yè)涉及醫(yī)學、理學、管理學、工學、文學、法學6個學科門類。堅持現(xiàn)代醫(yī)藥學與傳統(tǒng)醫(yī)藥學并重、以蒙醫(yī)藥學為特色協(xié)同發(fā)展，致力于建設具有區(qū)域特色的一流醫(yī)科大學。